ภารกิจและหน้าที่ความรับผิดชอบของแต่ละส่วนงาน ประกอบด้วย 5 ส่วน ดังนี้
1. ส่วนยุทธศาสตร์และอำนวยการ มีหน้าที่ความรับผิดชอบ ดังนี้
1) อำนวยการและบริหารจัดการเกี่ยวกับการบริหารทั่วไปของสำนักงาน เช่น งานสารบรรณ งานบุคคล งานการเงิน งานพัสดุ งานรักษาความปลอดภัย งานประชาสัมพันธ์
2) ดำเนินการพัฒนานโยบายและยุทธศาสตร์ในการป้องกันและแก้ไขปัญหายาเสพติดในพื้นที่รับผิดชอบให้สอดคล้องกับสภาพปัญหา สภาพแวดล้อม และนโยบายการแก้ไขปัญหายาเสพติดของชาติ รวมทั้งการวิเคราะห์ผล การปฏิบัติตามนโยบายเพื่อสรุปเสนอแนะให้มีการปรับปรุงแก้ไข
3) จัดทำแผนยุทธศาสตร์ และแผนปฏิบัติการในพื้นที่รับผิดชอบให้สอดคล้องกับสภาพปัญหายาเสพติด
4) ประสานสนับสนุนจัดทำแผนคำขอตั้งงบประมาณประจำปี และจัดทำแผนปฏิบัติการประจำปีของสำนักงานและส่วนราชการที่เกี่ยวข้องในพื้นที่รับผิดชอบ
5) วิเคราะห์และกลั่นกรองคำของบประมาณประจำปี และแผนปฏิบัติการประจำปีของหน่วยงานที่เกี่ยวข้องในพื้นที่รับผิดชอบ
6) ติดตามและประเมินผล โดยดำเนินการติดตาม ประมวลและรายงานผลการดำเนินงานป้องกันและแก้ไขปัญหายาเสพติดของหน่วยงานต่าง ๆ ในระดับภาคและระดับพื้นที่ รวมทั้งสนับสนุนการประเมินผลแผนงาน โครงการที่สำคัญ
7) ส่งเสริมและสนับสนุนงานด้านวิชาการ การพัฒนาทางวิชาการ การศึกษาวิจัย ตลอดจนสนับสนุนให้มีการศึกษาวิจัยสภาพปัญหายาเสพติด รูปแบบการดำเนินงานที่เหมาะสมกับพื้นที่ โดยเน้นลักษณะโครงการนำร่องเพื่อพัฒนานโยบาย และเป็นตัวแบบในการแก้ไขปัญหายาเสพติดที่เหมาะสม และขยายผลให้เกิดการปฏิบัติในพื้นที่ต่อไป
8) ดำเนินการพัฒนาบุคลากรทั้งภายใน และภายนอกสำนักงาน โดยใช้ระบบการฝึกอบรม จัดประชุมสัมมนา และศึกษาดูงานด้านการป้องกันและแก้ไขปัญหายาเสพติด
9) ดำเนินการรณรงค์เผยแพร่ประชาสัมพันธ์เพื่อการป้องกันและบำบัดรักษายาเสพติด รวมทั้งการผลิตสื่อและสนับสนุนให้มีการเผยแพร่สื่อด้านการป้องกันและแก้ไขปัญหายาเสพติดไปสู่กลุ่มเป้าหมาย
10) ประสานงานต่างประเทศโดยประสานและสนับสนุนความร่วมมือในการดำเนินงานป้องกันและแก้ไขปัญหายาเสพติดตามข้อตกลงระดับทวิภาคี และพหุภาคี ตลอดทั้งการดำเนินการแก้ไขปัญหายาเสพติดบริเวณชายแดน
11) อำนวยการและสนับสนุนการดำเนินงานตามโครงการส่งเสริมและสนับสนุนภาคประชาชนในการแก้ไขปัญหายาเสพติดในพื้นที่รับผิดชอบ
12) ทำหน้าที่เป็นแกนกลางในการบริหาร กำกับดูแล และร่วมปฏิบัติงานในโครงการพิเศษต่าง ๆ ที่เกิดขึ้นตามนโยบายของสำนักงาน ป.ป.ส.
13) ประสานและอำนวยการศึกษาดูงาน และสนับสนุนวิทยากรให้แก่หน่วยงานต่าง ๆ ตามที่ได้รับการร้องขอ
14) ปฏิบัติงานอื่นๆ ตามที่ได้รับมอบหมาย
2. ส่วนวิเคราะห์ข่าวและเฝ้าระวัง มีหน้าที่ความรับผิดชอบ ดังนี้
1) ดำเนินการตามวงรอบข่าวกรอง เริ่มจากอำนวยการข่าว โดยรับกำหนดเป็นหัวข้อข่าวสาร โดยคำนึงถึงปัจจัยแวดล้อมภายในและภายนอกองค์กร ได้แก่ นโยบาย สถานการณ์ภายในและต่างประเทศ รวมทั้งความเปลี่ยนแปลงภายในองค์กร
2) วางแผนรวบรวมข่าวสาร/ข่าวกรอง และวิเคราะห์ภารกิจให้ตรงกับหน่วยข่าว ชุดปฏิบัติการข่าว และแหล่งข่าวที่สำนักงาน ป.ป.ส. จัดตั้งขึ้น
3) ดำเนินกรรมวิธีทางการข่าว โดยเฉพาะการตรวจสอบ พิสูจน์ทราบ และประเมินค่าข้อมูล ข่าวสาร ข่าวกรอง จากระบบทะเบียนของหน่วยงานภายใน และภายนอก
4) สนับสนุนงานสืบสวน ขยายผลข้อมูลข่าวสารที่ได้จากหน่วย/ชุดปฏิบัติการข่าว และแหล่งข่าว เพื่อนำไปสู่การเชื่อมโยงการข่าว
5) กำหนดกรอบการพัฒนาระบบฐานข้อมูลยาเสพติดทั้งในด้านการข่าว การเฝ้าระวัง เพื่อบันทึก ประมวลผล ตรวจสอบประเมินค่า รวมทั้งผลิตรายงานข่าวกรองในรูปแผนผังความเชื่อมโยง (Link Diagram) ภาพจำลองสถานการณ์
6) ประสานและรวบรวมข้อมูลเชิงสถิติ การสำรวจ วิจัย และเอกสารวิชาการ เพื่ออ้างอิง สนับสนุนข้อมูลจากการข่าว เพื่อประโยชน์ในการวิเคราะห์ และคาดการณ์แนวโน้มสถานการณ์ยาเสพติดในระดับภาค และพื้นที่
7) ผลิตรายงานข่าวกรองยาเสพติด รายงานสถานการณ์ปัญหายาเสพติดทั้งในระดับพื้นที่ภาค/จังหวัด กลุ่มเครือข่ายและพื้นที่พิเศษ สำหรับสนับสนุนหน่วยปฏิบัติในพื้นที่
8) เป็นแกนหลักในการจัดระบบข้อมูลยาเสพติดเพื่อการพัฒนาห้องปฏิบัติการข้อมูลยาเสพติดของสำนักงาน ปปส.ภาค
9) สนับสนุนข้อมูลการข่าว สถิติ ข้อมูลการตรวจสอบจากระบบทะเบียนแก่ส่วนต่างๆ ภายในสำนักงาน ป.ป.ส. และโต๊ะข่าว ศพส. จังหวัด
10) ปฏิบัติงานอื่นๆ ตามที่ได้รับมอบหมาย
3. ส่วนประสานพื้นที่ มีหน้าที่ความรับผิดชอบ ดังนี้
1) พัฒนาและจัดระบบอำนวยการ และมาตรการในการป้องกันและแก้ไขปัญหายาเสพติดของจังหวัดต่างๆ ในพื้นที่รับผิดชอบ
2) อำนวยการ เร่งรัดการดำเนินงานตามแผนโครงการแก้ไขปัญหายาเสพติดที่กำหนดขึ้น และสำนักงาน ป.ป.ส. สนับสนุน
3) ประสาน ส่งเสริมและสนับสนุนการพัฒนาระบบอำนวยการและเทคนิควิชาการแก่หน่วยงานและองค์กรต่างๆ ในพื้นที่ ได้แก่ หน่วยงานภาครัฐ ภาคเอกชน องค์กรประชาชน และสถาบันองค์กรทางสังคม รวมทั้งพยายามประสานให้หน่วยงานองค์กรดังกล่าวเข้ามามีส่วนร่วมในการดำเนินงานป้องกันและแก้ไขปัญหายาเสพติด
4) สนับสนุนข้อมูลการข่าว สถานการณ์ปัญหายาเสพติด และให้คำปรึกษาแนะนำเกี่ยวกับแนวคิดและแนวทางการดำเนินงานตามมาตรการต่างๆ ในลักษณะของที่ปรึกษาด้านยาเสพติดแก่ผู้ว่าราชการจังหวัดและผู้บริหารระดับสูงของหน่วยงานในจังหวัด ตลอดจนองค์กรและหน่วยงานที่เกี่ยวข้อง
5) ติดตามผลการดำเนินงานและปัญหาอุปสรรคการป้องกันและแก้ไขปัญหายาเสพติดของหน่วยงานต่างๆ ในพื้นที่รับผิดชอบ
6) ปฏิบัติภารกิจและปฏิบัติการร่วมกับหน่วยงานและองค์กรต่างๆ ในพื้นที่รับผิดชอบ
7) ปฏิบัติงานอื่นๆ ตามที่ได้รับมอบหมาย
4. ส่วนอำนวยการบังคับใช้กฎหมาย มีหน้าที่ความรับผิดชอบ ดังนี้
1) ให้คำปรึกษาแนะนำด้านกฎหมาย ระเบียบ คำสั่งเกี่ยวกับยาเสพติด
2) อำนวยการ สนับสนุนและปฏิบัติการร่วมในการปราบปรามยาเสพติดกับหน่วยงานและองค์กรต่างๆ ในพื้นที่
3) ประสาน รวบรวม และสนับสนุนข้อมูลการข่าวยาเสพติดเพื่อประโยชน์ในการปราบปรามยาเสพติดในพื้นที่
4) กำกับ ติดตาม และปฏิบัติงานตามกฎหมายและระเบียบที่เกี่ยวข้องกับยาเสพติดในพื้นที่รับผิดชอบ
5) ควบคุม กำกับ ดูแล และอำนวยการตามระเบียบสำนักงาน ป.ป.ส. ว่าด้วยการยืมเงินล่อซื้อเพื่อการปราบปรามผู้จำหน่ายยาเสพติด พ.ศ. ๒๕๔๓ แก่หน่วยงานที่เกี่ยวข้อง
6) ดำเนินการตามระเบียบสำนักนายกรัฐมนตรี ว่าด้วย การป้องกันเจ้าหน้าที่ของรัฐมิให้เกี่ยวข้องกับยาเสพติด พ.ศ. 2542 และพระราชบัญญัติป้องกันและปราบปรามยาเสพติด พ.ศ. 2519 แก้ไขเพิ่มเติม (ฉบับที่ 3) พ.ศ. 2543 เกี่ยวกับสถานประกอบการในพื้นที่รับผิดชอบ
7) ปฏิบัติงานอื่นๆ ตามที่ได้รับมอบหมาย
5. ส่วนตรวจสอบทรัพย์สินและบังคับโทษปรับ มีหน้าที่ ความรับผิดชอบ ดังนี้
1) ตรวจสอบทรัพย์สินคดียาเสพติดตามพระราชบัญญัติมาตรการในการปราบปรามผู้กระทำความผิดเกี่ยวกับยาเสพติด พ.ศ. 2534 และกฎหมายหรือระเบียบที่เกี่ยวข้อง
2) ให้คำปรึกษา แนะนำ พนักงานเจ้าหน้าที่และผู้ที่เกี่ยวข้องในการปฏิบัติงานตามพระราชบัญญัติมาตราการในการปราบปรามผู้กระทำความผิดเกี่ยวกับยาเสพติด พ.ศ. 2534 และกฎหมายระเบียบที่เกี่ยวข้อง
3) รวบรวม พิจารณากลั่นกรองข้อมูล เอกสารหลักฐาน เพื่อเสนอคณะอนุกรรมการตรวจสอบทรัพย์สิน
4) ดำเนินการในฐานะเลขานุการคณะกรรมการตรวจสอบทรัพย์สินภาค
5) ประสาน และดำเนินการเกี่ยวกับการยึด อายัดทรัพย์สินตามกฎหมายว่าด้วยมาตรการในการปราบปรามผู้กระทำ
6) บริหารและจัดการทรัพย์สินที่ยึดหรืออายัด ขายทอดตลาด และรับมอบ ส่งมอบทรัพย์สิน
7) ดำเนินการบังคับโทษปรับในฐานะเจ้าหนี้ตามคำพิพากษา ตามกฎหมายว่าด้วยวิธีพิจารณาคดียาเสพติดในพื้นที่รับผิดชอบ
8) ร่วมสืบสวนทางการเงินของเครือข่ายการค้ายาเสพติด
9) ปฏิบัติงานอื่นๆ ตามที่ได้รับมอบหมาย
